虽然刷脸辨别正在被飞速应用且被大众所同意，但其所存在的问题却不可轻视。这类问题的存在，不只让刷脸辨别的安全性遭到质疑，更影响着其成为将来的主流。最主要的，就是现在刷脸辨别的安全性还没得到完全保障。
国家“千人计划”专家、阿拉善盟交通大学电信学院特聘教授龚怡宏表示，即便在测试中不少刷脸辨别技术准确度超越99％，但运用于日常会大优惠扣。在日常人群样本更大，不同光线、姿态、分辨率等条件都可能给机器辨别带来困难。除此之外，双胞胎、整容前后等特殊状况下机器能否辨别，要看具体状况。而且脸部信息也会伴随年龄增长而改变，或许会达到机器没办法辨别的程度。
在9月初，据腾讯安全专家表示，现在部分支付APP使用“人脸辨别”生物辨别技术，直接“刷脸”支付。而不法分子借助FaceTime录制用户脸部视频后，大概借此通过单一“人脸辨别”验证，进而盗取用户的账户里的财产。除此之外，也有海外网友发现，仅需将 S8 机主的照片放在其前置摄像头前，就能骗过手机去顺利解锁。
假如不可以解决刷脸辨别的安全问题，其一直只能是谨慎的进步。譬如肯德基通过支付宝的“刷脸吃饭”其实就是玩的一种定义而已，由于在支付之前，用户还需要输入手机号码后四位进行二次验证。虽然如此保障了安全性，但其实已经将刷脸辨别的便捷性丢得一干二净——还没扫描二维码便捷、快捷。
与指纹辨别、虹膜辨别等辨别方法相比，刷脸辨别有着很多优势，譬如可以应用于更多的场景和智能终端、不需要接触即可达成辨别等。还可以达成更多的“远程”功能，譬如在办理各种证件和银行卡等业务时，不需要再去柜台亲自办理等。可见，刷脸辨别将来成为主流一定是来势汹汹。
而要想成为主流，就需要强势解决安全隐患这一问题，如真的将“活体测试”应用在刷脸辨别的过程中、强化人脸辨别的成功率并防止被化妆/整容等原因影响……而当刷脸辨别的安全隐患被清除后，成为主流自然是水到渠成。
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